第1巻

 少年鑑別所を集団脱走した少年ジョーは、ある日001と名乗る人物にテストだと言われ、導かれるままにロボットと戦い、自分と同じ赤い服をきた集団と遭遇する。
 その集団は00ナンバーサイボーグだと名乗り、009だと言われ、自分たちと一緒に来るように言われる。
 そして、黒い幽霊団の基地を爆破して脱出した。